A kotrógépek virágzó fejlődésével, valamint a tudomány és a technológia rohamos fejlődésével a különböző kotrási cégek különböző típusú kotrógépeket fejlesztettek ki, hogy megfeleljenek a különböző projektek építési követelményeinek. A mérnöki projektekben általánosan használt kotrógépek két fő kategóriába sorolhatók: mechanikus és hidraulikus. A mechanikus kotrógépek elsősorban kotróberendezéseket használnak víz alatti földmunkákhoz, magát a berendezést pedig függőleges emeléshez a projekt céljainak elérése érdekében. Ezek elsősorban a markolókotrók, a kanalas kotrógépek és a létrás kotrógépek. A hidraulikus kotrógépek viszont mechanikus forgatással vágják át a víz alatti talajréteget, az üledéket vízzel keverve egy bizonyos koncentrációjú iszap keletkezik, amelyet aztán csővezetékeken keresztül szállítanak a partra. Ide tartoznak a szívó kotrógépek, a vágó szívó kotrógépek és a vontatott szívógaratos kotrógépek. A kotrógép kiválasztásakor figyelembe kell venni a projekt jellegét, valamint az építési terület meteorológiai, hidrológiai és földrajzi viszonyait.
Erős széllel és hullámokkal járó, menedék nélküli tengerparti és torkolati területeken önjáró, vontatott, szívógaratos kotrógépek ajánlottak-; a csővezetékes vágó szívó kotrógépeket általában a helyreállítási projektekkel együtt használják; a kanalas kotrógépeket kemény talajú tengerfenékhez használják; kis munkaterületeken, például a kikötői rakpartok elején, a markolókotrókat részesítik előnyben. A kotrási munkálatok során elengedhetetlen a szállítóhajók közlekedésének akadályozásának elkerülése, ügyelni kell a biztonságos üzemeltetésre, valamint gondoskodni arról, hogy minden létesítmény jó állapotban legyen. A kotrási terület pontos helyzetét a helyszínen ki kell jelölni-, és vízszintjelzőket, kotrási és kirakodási területjelzőket kell felállítani. A kotrási művelet biztonságának javítása érdekében gyakori mélységméréseket kell végezni.
